不同点主要表现在以下五个方面： （1）贷款主体不同。住房公积金贷款主体是住房公积金管理中心，商业性住房贷款主体是各商业银行。 （2）贷款对象不同。商业性个人住房贷款对象是经资信考察合格，具有还款能力的自然人，住房公积金贷款对象是除具备商业性贷款所要求的条件外，还必须是正常足额缴存公积金12个月以上的在职职工。 （3）贷款资金来源不同。商业性个人住房贷款资金来源是各商业银行的自营资金（居民或单位存款），而住房公积金贷款资金来源是职工个人及所在单位缴存的住房公积金。 （4）贷款利率不同。住房公积金贷款实行低存低贷的原则。 （5）贷款风险承担主体不同。商业性贷款风险由发放贷款的商业银行承担，公积金贷款风险由确定发放贷款的住房公积金管理机构承担。